Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC7Q8WUI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms