Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF548Q8NEK5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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ZNF548Q8NEK5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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ZNF548Q8NEK5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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ZNF548Q8NEK5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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