Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC112Q8NEF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms