Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNF248Q8NDW4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF248Q8NDW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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