Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms