Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L2Q8NAA4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms