Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3Q8N5Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms