Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms