Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms