Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM61Q8N0U2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM61Q8N0U2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms