Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms