Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms