Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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