Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms