Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms