Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms