Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS12Q6ZW61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms