Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549LQ6ZVL6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549LQ6ZVL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms