Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms