Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms