Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBR1LQ6UX01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms