Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXPE4Q6UWF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXPE4Q6UWF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms