Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms