Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UQCC3Q6UW78 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms