Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM220Q6QAJ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM220Q6QAJ8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms