Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms