Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC174Q6PII3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms