Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ULK3Q6PHR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ULK3Q6PHR2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms