Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC4Q6P2E9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms