Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CC2D1AQ6P1N0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CC2D1AQ6P1N0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms