Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL54Q6P161 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms