Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF40BQ6NWY9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms