Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms