Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWF2Q6IBS0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF2Q6IBS0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms