Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms