Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR78Q5VTH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms