Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms