Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms