Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms