Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VARS2Q5ST30 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARS2Q5ST30 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms