Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC39AQ5SRH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC39AQ5SRH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC39AQ5SRH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC39AQ5SRH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC39AQ5SRH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC39AQ5SRH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC39AQ5SRH9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms