Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47A1Q5JQC4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms