Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK2Q5EBM0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms