Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms