Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms