Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms