Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERKLQ49MI3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms