Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LONRF3Q496Y0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms