Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01559Q495D7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms