Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF212Q495C1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms